MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Niastella koreensis GR20-10 chromosome

Total Repeats: 23173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016609	T	9	9	1	9	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016609	AGA	2	6	11	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016609	TCG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016609	CGA	2	6	77	82	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016609	A	7	7	123	129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016609	AGT	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016609	T	6	6	1630	1635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016609	AACCCT	2	12	1699	1710	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016609	AAT	2	6	1918	1923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016609	A	6	6	1960	1965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016609	TCCC	2	8	2071	2078	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_016609	CCG	2	6	2092	2097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_016609	AAC	2	6	2144	2149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016609	TCC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016609	CGA	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016609	AAG	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016609	T	7	7	2267	2273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016609	AAAC	2	8	2304	2311	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016609	ACC	2	6	2312	2317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016609	TCA	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016609	TGC	2	6	2413	2418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016609	GCT	2	6	2490	2495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016609	GCA	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016609	CGT	2	6	2647	2652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016609	CAA	2	6	2658	2663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016609	CAA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016609	A	6	6	2712	2717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016609	TCA	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016609	T	6	6	2740	2745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016609	CCA	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016609	AAAT	2	8	2866	2873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016609	TCA	2	6	2910	2915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016609	AATGT	2	10	2930	2939	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016609	TGCA	2	8	3011	3018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016609	GAT	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016609	TGT	2	6	3098	3103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016609	T	6	6	3108	3113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016609	ATA	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016609	TTG	2	6	3208	3213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016609	TG	3	6	3243	3248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016609	AAT	2	6	3249	3254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016609	T	8	8	3259	3266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016609	TA	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016609	A	6	6	3290	3295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016609	T	6	6	3389	3394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016609	GAT	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016609	GAA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016609	AGT	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016609	TAAA	2	8	3514	3521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016609	A	7	7	3519	3525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016609	T	7	7	3544	3550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016609	ATT	2	6	3583	3588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016609	TAA	2	6	3809	3814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016609	TAA	2	6	3842	3847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016609	TAAA	3	12	3863	3874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016609	CA	3	6	3885	3890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016609	CCA	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016609	ATA	2	6	3946	3951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016609	TAT	2	6	3963	3968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016609	GTAA	2	8	6296	6303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016609	T	6	6	6323	6328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016609	TTTGA	2	10	6353	6362	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016609	CTT	2	6	6407	6412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016609	T	6	6	6436	6441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016609	TTA	2	6	6483	6488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016609	TTA	3	9	6810	6818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016609	A	6	6	6834	6839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016609	ATTA	2	8	6885	6892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016609	TAGT	2	8	6917	6924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016609	CTT	2	6	6931	6936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016609	TCA	2	6	6955	6960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016609	A	6	6	8063	8068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016609	TAA	2	6	8070	8075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016609	TAA	2	6	8088	8093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016609	ATTC	2	8	8120	8127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016609	TAT	2	6	8143	8148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016609	AAGAA	2	10	8151	8160	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016609	ACA	2	6	8224	8229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016609	TAAA	2	8	8251	8258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016609	TCT	2	6	9257	9262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016609	TGG	2	6	9264	9269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016609	CCAT	2	8	9278	9285	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016609	T	6	6	9588	9593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016609	TG	3	6	9601	9606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016609	ATAA	2	8	9669	9676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016609	A	6	6	9744	9749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016609	TGT	2	6	10387	10392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016609	GA	3	6	10411	10416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016609	TC	3	6	10430	10435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016609	AT	6	12	10447	10458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016609	T	7	7	10491	10497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016609	AAT	2	6	10509	10514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016609	ATT	2	6	10524	10529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016609	TCT	2	6	10560	10565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016609	TTA	2	6	10581	10586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016609	GCTT	2	8	10613	10620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016609	AAT	2	6	14230	14235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016609	A	7	7	15658	15664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016609	AGCC	2	8	15667	15674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016609	TTTA	2	8	17390	17397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016609	GGGA	2	8	17413	17420	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016609	CTGA	2	8	17447	17454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016609	TAA	2	6	17485	17490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016609	ATA	2	6	17512	17517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016609	A	6	6	17534	17539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016609	GTA	2	6	18262	18267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016609	TGAA	2	8	19224	19231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016609	GAATA	2	10	19243	19252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016609	ATT	2	6	19308	19313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016609	CA	3	6	19314	19319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016609	TAG	2	6	20990	20995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016609	TGT	2	6	21013	21018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016609	TTG	2	6	21702	21707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016609	T	6	6	21761	21766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016609	TG	3	6	21779	21784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016609	AAT	2	6	21785	21790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016609	A	6	6	21866	21871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016609	ATT	2	6	25178	25183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016609	T	6	6	25206	25211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016609	TAA	2	6	25244	25249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016609	T	6	6	25266	25271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016609	TAAAA	2	10	29111	29120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016609	A	6	6	29117	29122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016609	AT	3	6	34505	34510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016609	GAAT	2	8	38843	38850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016609	GAACA	2	10	38863	38872	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016609	T	9	9	38887	38895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016609	GAA	2	6	38901	38906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016609	AAG	2	6	44253	44258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016609	T	7	7	44284	44290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016609	AT	3	6	45076	45081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016609	TGT	2	6	45101	45106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016609	TGT	2	6	46934	46939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016609	GT	3	6	46968	46973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016609	ATT	2	6	47012	47017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016609	CTTT	2	8	47057	47064	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016609	CTA	2	6	47110	47115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016609	A	6	6	47143	47148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016609	GT	3	6	47164	47169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016609	TAATT	2	10	50082	50091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016609	A	6	6	50124	50129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016609	TCGG	2	8	50136	50143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016609	A	6	6	50145	50150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016609	TAAAGA	2	12	50866	50877	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016609	CAAT	2	8	50999	51006	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016609	GCTA	2	8	52213	52220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016609	A	7	7	52701	52707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016609	ATT	2	6	52744	52749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016609	AGT	2	6	52756	52761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016609	AAATG	2	10	52817	52826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016609	TATT	2	8	52854	52861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016609	AACA	2	8	52871	52878	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016609	ATA	2	6	53367	53372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016609	GAC	2	6	53394	53399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_016609	GTAC	2	8	58321	58328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_016609	TGA	2	6	58331	58336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016609	T	6	6	58376	58381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016609	TC	4	8	58426	58433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_016609	TGT	2	6	58522	58527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016609	T	7	7	58605	58611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016609	ACG	2	6	59953	59958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_016609	TGA	2	6	59962	59967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016609	TTTA	2	8	61655	61662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016609	GTA	2	6	64122	64127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_016609	CCG	2	6	64237	64242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_016609	ACAAA	2	10	64492	64501	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_016609	GAT	2	6	64523	64528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016609	GGT	2	6	64659	64664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_016609	TGA	2	6	64738	64743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016609	CCTG	2	8	64765	64772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
173	NC_016609	T	6	6	64778	64783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016609	A	6	6	64815	64820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_016609	TCAA	2	8	65450	65457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
176	NC_016609	CTTT	2	8	65511	65518	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
177	NC_016609	CCG	2	6	65597	65602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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179	NC_016609	CTT	2	6	65731	65736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_016609	GAA	2	6	65770	65775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_016609	AATT	2	8	65851	65858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_016609	TGG	2	6	66009	66014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_016609	AAT	2	6	66161	66166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_016609	CATC	2	8	66223	66230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
190	NC_016609	A	6	6	66240	66245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_016609	CTT	2	6	66258	66263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_016609	T	6	6	66272	66277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_016609	TCT	2	6	68624	68629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_016609	A	6	6	68633	68638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_016609	CAA	2	6	69636	69641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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201	NC_016609	GTT	2	6	78293	78298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_016609	CAA	2	6	109021	109026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_016609	AAT	2	6	110746	110751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_016609	GTG	2	6	112053	112058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016609	CAC	2	6	112065	112070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_016609	ACCA	2	8	112084	112091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
289	NC_016609	ATTG	2	8	112141	112148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_016609	GTAT	2	8	112167	112174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
292	NC_016609	TTA	2	6	113379	113384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_016609	TGA	2	6	113398	113403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_016609	A	6	6	113442	113447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_016609	TAT	2	6	113454	113459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_016609	TTG	2	6	113480	113485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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310	NC_016609	A	8	8	115423	115430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_016609	GGT	2	6	121463	121468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_016609	ATA	2	6	148109	148114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_016609	A	7	7	151930	151936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_016609	AGA	2	6	151989	151994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_016609	AAGC	2	8	152013	152020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
433	NC_016609	TAA	2	6	152034	152039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_016609	CCG	2	6	152624	152629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_016609	AT	3	6	154292	154297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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